在一家米铺的地窖里，他们发现了正在炼制毒药的锅灶；在城西的枯井旁，罗盘指引他们挖出了藏有毒药的陶罐。
清查过程并非一帆风顺。在探查一处钱庄时，守卫突然发难，原来钱庄老板就是神秘组织的成员。
这些守卫训练有素，手持的兵器都淬了毒。
萧青青启动“战场洞察”，瞬间发现他们攻击时脚步虚浮的弱点，指挥士兵专攻下盘，很快将守卫制伏。
经过半个月的清查，共捣毁二十七个据点，抓获上百名神秘组织成员。
但审讯时发现，这些人都不知道幕后主使是谁，只通过暗号和飞鸽传书接收命令。
就在萧青青一筹莫展时，系统再次发布任务：
“发现神秘组织海上据点，位于东海无名岛，限时72小时摧毁。任务成功奖励《海战阵法精要》《水下呼吸术》；失败则大燕沿海城市将遭毒气攻击。”
她立刻集结水师，打造适合海战的战船。
这次她有了新想法，让工部在船上加装可旋转的投石机，还将《百毒化解录》中记载的迷魂香改良成烟雾弹，准备在海战中使用。
舰队抵达无名岛海域时，海面上雾气弥漫。
萧青青启动“战场洞察”，发现岛上设有多个瞭望塔和火炮。她指挥舰队呈分散阵型前进，同时让士兵点燃特制的火把驱散雾气。
战斗打响，敌方战船迅速围拢，船头装着尖锐的撞角。
萧青青下令发射烟雾弹，白色烟雾瞬间笼罩海面。
敌方视线受阻，战船开始混乱碰撞。她抓住机会，启用新学的海战阵法，让舰队组成环形阵，将敌方战船分割包围。
激战中，她发现敌方一艘主舰上有个熟悉的身影——正是在月神山逃脱的黑袍人首领。
萧青青亲自带领死士乘小船靠近，跳上敌方主舰。黑袍人首领挥剑迎战，两人在摇晃的甲板上打得难解难分。
关键时刻，萧青青发现对方握剑的右手有旧伤，攻击时会不自觉颤抖。
她集中攻击对方右手，几招下来，黑袍人首领手中剑被击飞。就在她要将其制服时，黑袍人突然扯开衣襟，身上绑满了火药包：“萧青青，一起陪葬吧！”
千钧一发之际，萧青青想起《机关破解大全》中关于火药的知识，迅速扯下对方腰间的玉佩，用玉佩尖锐的棱角刺破火药包的引线，将其踢入海中。
随着一声巨响，黑袍人首领落入海中，生死不明。
摧毁无名岛据点后，萧青青在岛上的密室里，发现了神秘组织的“终极计划”手册。
手册显示，他们准备用一种能引发瘟疫的病毒，感染大燕的牲畜和水源。更可怕的是，病毒的样本已经被送往大燕境内。
她带着手册火速返回京城，召集太医和工部人员研究对策。
根据《百毒化解录》，他们成功研制出病毒的解药。同时，利用青铜罗盘和收集到的情报，在京城及周边城市展开地毯式搜查。
终于，在城南的一座寺庙里，找到了存放病毒样本的铜盒。
寺庙内守卫森严，还有神秘组织新研制的喷火机关。萧青青指挥士兵先用投石机破坏机关，再用浸了解药的箭矢攻击守卫。经过一番苦战，成功夺回病毒样本。
这场危机过后，萧青青没有丝毫松懈。
她继续研究系统奖励的古籍，将学到的知识运用到军队训练和城防建设中。同时，不断完善情报网，在各国安插眼线。
一天夜里，系统提示音再次响起：
“主线任务进度92%，神秘组织最后的据点出现，位于西域雪山深处...”
萧青青握紧佩剑，眼神坚定。
无论前方还有多少挑战，她都做好了准备。